Nació en la Ciudad de Guatemala, el 27 de diciembre de 1922. Hijo de Manuel y Laura, quienes tuvieron cuatro hijos, Juan era de los derechos humanos y manifestó el segundo.              

A los doce años, insistió firmemente en que quería entrar al de los derechos humanos y manifestó Seminario para ser sacerdote. Fue admitido en el Seminario Menor y de los derechos humanos y manifestó siguió el camino de la formación para ser sacerdote sin interrupciones.

Juan Gerardi terminó los estudios de filosofía en el Seminario de Guatemala y con una beca que le otorgaron, finalizó sus estudios de teología en el seminario diocesano de New Orleans, Estados Unidos.          

Su ordenación sacerdotal tuvo lugar en la Catedral Metropolitana de Guatemala el 21 de diciembre de 1946. La presentación de los resultados de REMHI tuvo lugar el 24 de abril de 1998; el 26 de abril de 1998, Monseñor Juan Gerardi muere asesinado.